Clases online de Python específicas para Biología Molecular

Programación para Biología Molecular Python para estudiantes y profesionales de Biología, Biotecnología, etc. desmitificando la programación para Biólogas/os Metodología: En la parte teórica el alumno irá tomando apuntes y observando diapositivas en una web de diseño propio mientras explico la clase a través de Google Meet. En la parte práctica usará un intérprete de Python para desarrollar los programas propuestos y aquí es indispensable instalar la aplicación Escritorio Remoto de Chrome. Temario orientativo de las clases: Capítulo 1 Tema 1: Una CDS traducida a proteína 1.1_Conceptos básicos de programación en Python I 1.2_Operaciones sobre strings y funciones incorporadas 1.3_Importancia del % de GC y estructura de datos complejas 1.4_Conceptos básicos de programación en Python II 1.5_Complemento reverso-Bucles y condicionales 1.6_Colinealidad entre genes y proteínas procariotas 1.7_Gen Thrl traducido a proteína. Evaluación final: -Asimetría de la replicación de E.coli. Tema 2: Marcos abiertos de lectura 2.1_Funciones, módulos y archivos FASTA 2.2_Genoma del colifago Phi X 174 2.3_ Paquete y modularización. 2.4_ORFs del colifago en el NCBI y gráficos comparativos. 2.5_Porcentaje de bases por posición y gráfico. Evaluación final Capítulo 2 Tema 3: Sesgo en el uso de codones 3.1_ Programación orientada a objetos 3.2_Objeto Seq, SeqRecord y diccionarios anidados 3.3_ Calcular la frecuencia de codones de P. falciparum 3.4_Gráfico comparativo Evaluación final Tema 4: Expresión genética y motivos funcionales en el ADN 4.1_Chip-on-chip-Microarrays 4.2_Análisis de datos con NumPy y Excel 4.3_Transcription factors binding sites (TFBS) con Biopython 4.4_Enzimas de restricción y expresiones regulares

Materias que imparte Eduardo

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Las clases se harán

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